Willi Flemming engagierte sich verstärkt für ideologische Arbeiten der NS-Ideologie. So fungierte er als Redner des NS-Lehrerbundes (ab 1933), als Reichslektor und Landesreferent der 'Reichsstelle zur Förderung des deutschen Schrifttums' (ab 1934) und als Leiter der Abteilung Schrifttum im 'Kampfbund für deutsche Kultur' (ab 1934). 1936 wurde er zum Gauschrifttumsbeauftragen für Mecklenburg-Lübeck im Amt Rosenberg berufen und ab 1938 zum kommissarischen Leiter, später Hauptleiter der Stelle für Büchereiwesen der Gauleitung Mecklenburg der NSDAP. Seit 1940 beteiligte er sich zudem publizistisch am 'Kriegseinsatz der Geisteswissenschaften'. 1945 wurde Flemming aus seinem Amt entlassen. Als Begründung wurde seine NSDAP-Mitgliedschaft angegeben.