Carl Wilhelm Wirtz arbeitete an der Universität Kiel eng mit Hans Rosenberg zusammen. Bereits 1933 war Wirtz vorgeworfen worden, der NSDAP kritisch gegenüber zu stehen. Als er das bestritt, konnte er zunächst weiterarbeiten. Nach Rosenbergs Absetzung wurde jedoch auch für Wirtz die Arbeit an der Kieler Universität zunehmend schwerer. 1937 wurde ihm die Lehrbefugnis aus politischen Gründen entzogen. Zu dieser Zeit litt Wirtz bereits an einer unheilbaren Krankheit, an der er 1939 starb. Ihm zu Ehren wurden der Asteroid (26074) Carlwirtz und der Marskrater Wirtz nach ihm benannt. Wirtz ist 1930 aus der katholischen Kirche ausgetreten.