Prof. Gärtner war an der Christian-Albrechts-Universität zu Kiel in der akademischen Selbstverwaltung engagiert, u.a. war er Vorsitzender des Verwaltungsrates der Universität. Ende der 1960er Jahre wurde in einer Verleumdungskampagne der studentischen Zeitung 'Konkret' behauptet, dass Gärtner im Rahmen einer Forschungsstelle der Bundeswehr an ABC-Waffen experimentiert hätte. Gärtner legte hiergegen eine Klage auf Verleumdung ein. Dieser Prozess zog sich über acht Jahre hin. Schließlich wurde entschieden, dass die Vorwürfe gegen Gärtner haltlos waren (Vgl.: Focus Magazin Nr. 22 (1998)).